yNagaokaのブログ

このブログはNGS解析初心者がつまずいた部分と解決方法をまとめた覚書のようなものです。

Docker

WSLがストレージを異常に圧迫する問題を解決したときの覚書

はじめに 私はWindowsユーザーでWSLを利用しているのですが、最近PCが異常にフリーズするしデータ解析中にストレージ不足のエラーが頻発するようになりました。 色々な記事を参考にしてストレージを開放するために奮闘したのでその作業の覚書を残しておこう…

ローカルのDocker imagesからSingularity imageを作りたいときの覚書

はじめに 最近はSingularityの使い勝手がよく感じられて、Docker imageをbulidしてはSIFを作製しています。色々なツールを使っていると、あるものはPython3.9が必要だったり、あるものは3.7が必要だったりnumpyやpandasのバージョンが特定のものじゃないとエ…

Dockerとは何か?の覚書ーその1

はじめに NGS解析を始めると様々な解析ツールを使う機会が増え、GitHubやDockerHubで公開しているものに出会うと思います。それらを全く知らない初心者からしたら何それ?どうやって使うの?といった感じになると思います。ウェット出身の私もそうでした。今…