はじめに 私はWindowsユーザーでWSLを利用しているのですが、最近PCが異常にフリーズするしデータ解析中にストレージ不足のエラーが頻発するようになりました。 色々な記事を参考にしてストレージを開放するために奮闘したのでその作業の覚書を残しておこう…

はじめに 最近はSingularityの使い勝手がよく感じられて、Docker imageをbulidしてはSIFを作製しています。色々なツールを使っていると、あるものはPython3.9が必要だったり、あるものは3.7が必要だったりnumpyやpandasのバージョンが特定のものじゃないとエ…

はじめに とある解析ができるようにDockerfileからDocker imageを作成して、それを基にSingularity imageを作ることにしました。その解析では特定のバージョンのPythonパッケージを使用する必要があり、Dockerfile内でそのバージョンを指定してインストール…

はじめに Singularityのイメージやインストール方法が分かったところで、今回はどうやって使うのかに関してまとめたいと思います。 Singularityの使い方 基本的にはDockerと同様にimageからコンテナを作成して実行します。 ・SingularityのコンテナであるSin…

はじめに Singularityとは何か？は前回のまとめで大体イメージができたかと思いますので実際にインストールしてみたいと思います。 SingularityCEをネイティブに動作させるにはLinuxシステムが必要です。また、Linux, Windows, Macそれぞれインストール方法…

はじめに 今回はDockerと合わせて重要になるSingularityに関して簡単にまとめようと思います。Singularityの公式ユーザーガイドは以下を参照してください。 https://docs.sylabs.io/guides/latest/user-guide/:embed:cite Singularityとは？ ・Singularityは…